In de archiefafdeling worden zowel archieven van particulieren en van kleinschalige verenigingen als van grote organisaties met nationale of internationale uitstraling bewaard. Het materiaal is van zeer uiteenlopende aard. Traditionele verslag- en kasboeken en met de hand geschreven vertrouwelijke briefwisseling liggen er naast statistieken, microfilms of diskettes. Er wordt ook gewerkt aan de opbouw en bewaring van gesproken archief (interviews).

De archieven worden op een professionele manier geordend en toegankelijk gemaakt. Zij kunnen worden geraadpleegd na toestemming van de eigenaar.

Daarnaast beheert de archiefafdeling honderdduizenden foto's, affiches, films, video- en geluidsbanden, cd's, dia's, bid- en devotieprentjes, vlaggen, medailles enz., aan de hand waarvan men zich een uitstekend beeld kan vormen van katholiek Vlaanderen, nu en in het verleden.

Elke categorie wordt volgens een eigen systeem ontsloten en kan doorgaans vrij worden geraadpleegd.